在國家重點研發計劃“七大農作物育種”專項“主要農作物雜種優勢形成與利用機理”(項目編號:2016YFD0100800)資助下,中國農業大學賴錦盛教授課題組在玉米雜種優勢機理方面取得重要進展。研究成果以“ExtensiveintraspecificgeneorderandgenestructuralvariationsbetweenMo17andothermaizegenomes”(種內基因順序和基因結構變異應該對雜種優勢和基因組進化有影響)為題,于近日在NatureGenetics《自然·遺傳》上在線發表。
玉米是一種重要的糧食作物及經典的遺傳模式植物,其自交系之間存在著廣泛的遺傳變異,不同雜種優勢群之間的雜交后代表現出極高的雜種優勢現象。以B73自交系為代表的Reid群和以Mo17自交系為代表的Lancaster群是世界上*經典也是**的兩個玉米雜種優勢群。該研究利用第三代測序技術(PacBio單分子測序技術)和BioNano映射技術組裝了高質量的玉米Mo17基因組。通過比較B73與Mo17兩個基因組,發現在染色體上的基因排列順序上至少有10%的基因存在非共線性現象,同時基因組結構變異上至少20%的基因存在有可能導致蛋白編碼功能改變的重要序列突變。玉米不同自交系基因組間存在的遺傳變異相比其他物種內部的遺傳變異更為突出,這些種內基因順序和基因結構的變異對雜種優勢和基因組進化有重要影響。該研究結果在基因組學層面對玉米自交系間能夠形成特別顯著的雜種優勢的原因提供了一個新的解釋。
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