近日,Horticulture Research在線發表了大連理工大學生命科學與技術學院欒雨時教授課題組完成的題為“Tomato lncRNA23468 functions as a competing endogenous RNA to modulate NBS-LRR genesby decoying miR482b in the tomato- Phytophthora infestans interaction”的論文。該成果是在國家自然科學基金的資助下,他們長期致力于番茄抗病相關非編碼RNA的研究,發表二十余篇miRNA(Horticulture Research, 2018, 5:9; Plant Cell and Environment, 2018, doi: 10.1111/pce.13468;等)及多篇lncRNA(The Plant Journal, 2017, 89: 577-589; The Plant Journal, 2018, doi:10.1111/tpj.14173; 等)論文的基礎上,將miRNA與lncRNA協同調控的作用綜合研究的產物。該文不僅有利于加深人們對番茄抗晚疫病機制的理解,還可為其他植物非編碼RNA的研究提供參考。
miR482b負調控番茄的抗性,過表達它的植株易感晚疫病。葉片接種病原菌后,miR482b的表達量顯著降低,但其作用機制尚不清楚。該文作者編寫了特定程序,從番茄RNA-Seq數據中鑒定出89個具有原始內源靶標模擬物(eTM)的lncRNA,可沉默46個miRNA。研究發現lncRNA23468、lncRNA01308和lncRNA13262均含有miR482b的保守eTM位點。當lncRNA23468在番茄中過表達時,miR482b及其靶基因NBS-LRR的表達分別出現顯著的降低和升高,抗病性得以增強;而沉默lncRNA23468則導致miR482b的積累,NBS-LRR減少,抗病性下降。將lncRNA23468的eTM位點突變(mlncRNA23468)后,未造成miR482b、NBS-LRR及植株抗病性的顯著改變。說明lncRNA作為eTM可調控miRNA,lncRNA23468-miR482b-NBS-LRR相互作用影響著番茄對晚疫病的抗性。
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