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    微生物能固定天然氮肥，轉化氨氣、硫化氫為肥分，溶化土壤中不溶性的磷酸鹽為磷肥，又能自行光合作用製造葡萄糖。微生物也可合成氨基酸、核酸等有機肥分，分解纖維、澱粉等高分子醣類為有利植物的低分子醣類，更能分泌各種有機酸、抗生物質、生長激素，以促植物生長、提高抗病力，利用微生物的肥料製劑，除活酵菌肥(固態)與酵素液肥(液態)等等之外

  1. 綜合微生物：內含非共生固氮菌、溶磷菌、乳酸菌、酵母菌、光合成菌、放線菌、生長俊等等，效果多元化，是有機農法初學者絕對需要的資材。 2. 光合酵素：利用光合成菌提供的葡萄糖、類胡蘿蔔素，以達催甜、催大、催色的效果，並利用它來解除氨氣、硫化氫等毒素。 3. 固氮酵素：為非共生性固氮菌，以Azotobacter屬及Azotospirillium屬無主，無寄主專一性，可促進各種作物根系對水分、養分之吸收力，並能分泌植物生長素(IAA)及細胞分裂素(Cytokinin)。與光合成菌配合應用，則相輔相成，效果尤彰。 4. 固氮、光合酵素：利用非共生的固氮菌群配合以光合成菌，用來噴葉及灌根，不但兼顧光合作用及固氮作用，而且又能達到此兩菌群相輔相成的效果。 5. 生長酵素：利用分泌激勃素、細胞分裂激素……等等生長促進素的菌群來增進植物生長。 6. 內生菌根菌：除少數植物外(十字花科等)能與大部分草本植物共生，尤其用於植物幼苗之感染特別有效。內生菌根菌可促進根部生長，幫助磷肥吸收。 7. 放線共生菌(Frankia)：形成林木根瘤之固氮菌，可感染雙子葉木本植物，尤以赤楊、木麻黃、楊梅為*。 8. 根圈固氮酵素：以根瘤菌為主，固氮效率良好，但限於共生，只適用於豆科植物。 9. 溶磷菌：可助土壤中難溶性無機磷鹽溶化之微生物的通稱，綜合土壤微生物群即包括所有溶磷菌。微生物中硫酸氧化細菌(Thiobacillus屬)、硝化菌(Nitrosomonas屬、Nitrobacter屬)等菌類可產生硫酸及硝酸以幫磷酸鹽的溶解。另外尚有桿菌(Bacillus屬)、假球菌(Pseudomonas屬)、鏈黴菌(Streptomyces屬)、麴菌(Aspergillus屬)、青黴菌(Penicillium屬)……等等，幾乎所有菌類都能生產有機酸。有機酸的種類也很多，主要如糖膠酸、黃酸、碳酸、柜櫞酸、修酸、乳酸、琥珀酸、醋酸……等等，其他還有一些有關磷酸分解酵素(如phospholipase、nuclease、phytase)等都與溶磷作用有關，這些有機酸具嵌合作用(Chelation)，可與陽離子嵌合而使磷酸可溶化。因為這些菌類都屬一般土壤微生物群，做好有機農法就可達到溶磷效果，使土質疏鬆。二、生物防治 1. 菌類的利用：利用微生物或其毒性物質作為防治病蟲害的藥劑，因其毒效專一性高，對人畜及環境的危害遠比化學農藥為低，沒有藥劑殘留問題，因此對人體健康及環境生態影響上都非常重要。 a. 蘇力菌(Bacillus thuringiensis)：革蘭氏陽性細菌，可產生內生孢子及結晶毒蛋白，對鱗翅目的蛾類、鞘翅目的甲蟲類及雙翅目的蚊蚋類有效。利用米糠、糖蜜混合施用於地面，吸引昆蟲來攝食，可提高效果。 b. 放線菌(Actinomyces屬)ST9：可分泌各種抗生素(Antibiotics)、抗菌素、殺蟲物質(如Blastocysin、Avermectin……等)，除有效拮抗作用外，並具分解纖維質及幾丁質之功能。使用時利用蟹殼粉(30%)、篦麻粕(60%)、糖蜜(10%)混合後，再以ST9(300倍液)澆濕，用厚布或塑膠布覆蓋，發酵一星期後翻推，再一星期後，即可用以薄層散佈稀釋使用，如果再配合蟹殼膠(幾丁酸Chitosan1/3000)使用，則效果倍增。 c. 絲狀菌(如黑殭菌Metarhizium屬、白殭菌Beauveria屬、綠殭菌Nomurese屬、紅殭菌Paecilamyces屬)等：均屬"蟲生真菌"，能自昆蟲表面感染，不需靠昆蟲攝食。 d. 假球菌(Pseudomonas屬)ST4：可分泌Pseudobactin、Pyrralnitrin及Pyluteorin等抗菌物質，具抑病及促進生長的效果。為"促進植物生長根圈菌"(PGPR)。 e. 木黴菌(Trichoderma屬)ST12：可產生多種抗菌物質，好酸性及高溫，能以寄生方式攻擊病源絲狀菌。 f. 枯草菌(Bacillus)：常見於土壤或枯草中，為革蘭氏陽性桿狀細菌。具耐熱性，對醣類、蛋白質之分解力強，繁殖速度快，可產生廣效抗生物質，對多種病原菌具有強力抗菌活性，但其分泌物則對植物根部生長有抑制之反效果，放太多的枯草菌反對植物生長不利。 g. 酵母菌(Yeast)：可生存於人體腸內，為半嫌氣性桿狀菌。乳酸飲料之發酵菌，所產生之乳酸具強酸性，可抑制病原菌之繁殖。 h. 微生物除草劑：利用寄主專一性，感染致病力強的植物病原菌或其酵素來消除雜草，可取代農藥中使用量*的化學除草劑的一部份，可用菌種有Fusariun屬的Lateritium、roseum等，或Phytophthora palmivora及Collectotrichum gloeosporioides及Alternavia macrospora等，另外還有由Streptomyces hygroscopicus抽取而得之含磷Peptide製成枝除草劑，此類因作用極端專一性的關係，實際應用上將有相當的困難。 i. 綜合有益微生物：除了拮抗菌的直接作用外，土壤中的有益微生物群體大量繁殖，佔領根圈區域，微妙地控制根區之營養成分及氧氣分配，控制其pH值及氧化還元電位等的物理性環境，菌群優勢的形成能有效地抑制病原菌的繁殖。 j. 堆肥的利用：利用堆肥發酵的方式來大量繁殖有益土壤微生物，即可利用其拮抗作用來抵制病害菌，自然地取代了農藥的需求量，發揮防與治的效果。 k. 糖醋液和有機液肥：含多種有機酸、抗菌、殺蟲物質，可有效抑制病蟲害。 l. 其他如絲狀菌Arthrobotoris：更能形成圈套，當線蟲觸及圈套時，即收緊而將線蟲束縛致死。又如原生動物變形蟲類，亦可直接吞食細菌，土壤微生物中的Virus(噬菌體Phage)則能將其本身的基因侵入細菌體內繁殖後，再將整個細菌體溶化。 2. 昆蟲病原病毒的利用：可使昆蟲大量致病死亡並具持續感染作用，可達長期防治病蟲害之效，付諸實用者有核多角體病毒(NPV)及顆粒病毒(GV)屬Baculovirus病毒，另外還有細菌質多角體病毒(CPV)屬Reovirus病毒。 3. 弱毒性病毒的利用：可防止病原菌的發生，如利用煙草病毒(TMV)的L11A弱病毒，網面香瓜病毒(CGMMV)之CMV-SR弱病毒等。 4. 天敵的利用：人工培養天敵，如用卵寄生蜂防治玉米螟，補植蹣防治葉蹣，姬蜂防治甜菜蛾，釉小蜂防治椰子紅胸葉蟲……等等。天敵的人工培養不易，且防治對象侷限，實用上比較困難。 5. 誘殺法：利用含毒誘餌、性費洛蒙(雌性昆蟲吸引異性氣味物質)、黃色粘板及改造後的保特瓶等以誘殺昆蟲。 6. 不孕性昆蟲的利用：以鈷六十輻射線或藥劑使成不孕成蟲，施放田間以妨礙正常受孕，減少昆蟲後代群，此法用於果實蠅之防治，成效甚佳。 7. 遮斷保護法：利用細網張羅果園，以妨害蟲及鳥類的侵入，或用套袋保護果實。明溝灌水，灑石灰圈以阻隔移行性昆蟲，利用塑膠布簡易溫室或網室栽培以減少蟲害等。 8. 自然農藥的利用：利用木醋液(醺燒木屑、粗糠等之煙霧凝聚液)、釀造醋、大蒜、辣椒、艾草、除蟲菊、魚藤、煙草、硫磺粉、樟腦油、牛乳、苦苓油、苦茶油、篦麻粕、蟹殼粉、蟹殼膠、消石灰、煤油、丁香油……等等，可有效防治蟲害用臺研液肥種出來的蔬菜長得快，味道鮮美，保鮮時間長，種的果樹結的果實也味道鮮甜，增產增收，效果這么好，你還等什么？